تلتزم جامعة تبوك بالاستخدام الفعال لجميع الموارد الطبيعية بما في ذلك المياه. كما تعزز الجامعة الاستخدام الواعي للمياه في الحرم الجامعي. كذلك يوجد في الجامعة محطة لمعالجة مياه الصرف الصحي والتي تعتمد على تكنولوجيا أغشية المفاعل الحيوي Membrane Bio Reactor .